Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF728P0DKX0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF728P0DKX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF728P0DKX0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1647.2 ms