Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF4O43474 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF4O43474 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF4O43474 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF4O43474 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF4O43474 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF4O43474 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF4O43474 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF4O43474 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF4O43474 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF4O43474 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF4O43474 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF4O43474 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF4O43474 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF4O43474 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF4O43474 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF4O43474 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF4O43474 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF4O43474 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF4O43474 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF4O43474 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF4O43474 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF4O43474 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF4O43474 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF4O43474 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF4O43474 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF4O43474 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF4O43474 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF4O43474 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF4O43474 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF4O43474 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF4O43474 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF4O43474 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF4O43474 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF4O43474 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF4O43474 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF4O43474 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF4O43474 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF4O43474 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF4O43474 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF4O43474 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF4O43474 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF4O43474 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF4O43474 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF4O43474 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF4O43474 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF4O43474 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF4O43474 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF4O43474 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF4O43474 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF4O43474 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF4O43474 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF4O43474 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF4O43474 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF4O43474 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF4O43474 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF4O43474 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF4O43474 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF4O43474 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF4O43474 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms