Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C5orf60A6NFR6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf60A6NFR6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf60A6NFR6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf60A6NFR6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms