Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ09 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ09 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQ09 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQ09 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms