Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 EFCAB13-203ENST00000517484 3466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 KLHL14-202ENST00000359358 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXL7-201ENST00000329673 3960 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 RIMBP2-202ENST00000535703 3685 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCAM1-226ENST00000619839 2993 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SUFU-203ENST00000423559 2601 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MOCS1-203ENST00000373186 4256 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SIGLEC10-202ENST00000353836 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRAMD2A-201ENST00000309731 3281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NELL2-204ENST00000437801 3279 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 GCNT1-203ENST00000444201 5476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 IFT122-215ENST00000507564 3824 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC012651.1-204ENST00000495723 3881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC064805.1-202ENST00000569279 3493 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGSF11-203ENST00000425327 3525 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF574-204ENST00000600245 3598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CMKLR1-201ENST00000312143 5283 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAF3IP2-201ENST00000340026 2785 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms