Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 421.1■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 320.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 520.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 316.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-12■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBAC2-211ENST00000494576 1855 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 NCK2-204ENST00000425756 494 ntTSL 314.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBE3B-210ENST00000539599 2763 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CNN3-203ENST00000415017 792 ntTSL 213.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 212.69□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBE3B-204ENST00000449510 3771 ntTSL 512.37□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 PFAS-207ENST00000581288 527 ntTSL 411.91□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-201ENST00000316738 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 UBE3B-205ENST00000535900 677 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-12■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 29.89□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 PFAS-211ENST00000585319 598 ntTSL 39.65□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CNN3-205ENST00000474409 544 ntTSL 38.32□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 PFAS-208ENST00000583059 349 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.19e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.227e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 ADAR-208ENST00000529168 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.57□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALGAPB-206ENST00000461423 3830 ntTSL 24.86□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-213ENST00000557685 698 ntTSL 32.98□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-204ENST00000553871 624 ntTSL 52.5□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-210ENST00000556078 449 ntTSL 32.33□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.81e-6■■■■■ 48.8
TBRG4Q969Z0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 48.8
TBRG4Q969Z0 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 48.8
TBRG4Q969Z0 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 48.8
TBRG4Q969Z0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 48.6
TBRG4Q969Z0 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 49.43□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 48.6
TBRG4Q969Z0 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 48.6
TBRG4Q969Z0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 521.03■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-208ENST00000447441 944 ntTSL 219.94■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-206ENST00000438603 519 ntTSL 48.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 CBLB-207ENST00000443752 561 ntTSL 38.14□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.558e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 34.95□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 48.4
TBRG4Q969Z0 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 225.61■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 223.73■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 521.49■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 320.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 320.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 48.3
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 126.9 ms