RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392102.5

TTLL4-202, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL4, Length 4,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-202ENST00000392102 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.58■□□□□ 0.88
TTLL4-202ENST00000392102 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.94■□□□□ 0.62
TTLL4-202ENST00000392102 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.73■□□□□ 0.59
TTLL4-202ENST00000392102 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
TTLL4-202ENST00000392102 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.81■□□□□ 0.44
TTLL4-202ENST00000392102 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.61■□□□□ 0.41
TTLL4-202ENST00000392102 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.54■□□□□ 0.4
TTLL4-202ENST00000392102 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.53■□□□□ 0.4
TTLL4-202ENST00000392102 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TTLL4-202ENST00000392102 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TTLL4-202ENST00000392102 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.4■□□□□ 0.38
TTLL4-202ENST00000392102 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TTLL4-202ENST00000392102 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TTLL4-202ENST00000392102 HRCP23327 699 aa17.11■□□□□ 0.33
TTLL4-202ENST00000392102 TRIM41Q8WV44 630 aa17■□□□□ 0.31
TTLL4-202ENST00000392102 ABCC9O60706 1549 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL4-202ENST00000392102 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.87■□□□□ 0.29
TTLL4-202ENST00000392102 SCRIBQ14160 1630 aa16.79■□□□□ 0.28
TTLL4-202ENST00000392102 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL4-202ENST00000392102 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL4-202ENST00000392102 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TTLL4-202ENST00000392102 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TTLL4-202ENST00000392102 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.243e-9■■■■□ 26
TTLL4-202ENST00000392102 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL4-202ENST00000392102 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.44■□□□□ 0.22
TTLL4-202ENST00000392102 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTLL4-202ENST00000392102 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.22
TTLL4-202ENST00000392102 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.39■□□□□ 0.21
TTLL4-202ENST00000392102 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.26■□□□□ 0.19
TTLL4-202ENST00000392102 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TTLL4-202ENST00000392102 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TTLL4-202ENST00000392102 WIZO95785 1651 aa16.17■□□□□ 0.18
TTLL4-202ENST00000392102 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTLL4-202ENST00000392102 ABCC8Q09428 1581 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL4-202ENST00000392102 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL4-202ENST00000392102 SOGA1O94964 1423 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL4-202ENST00000392102 CCDC88BA6NC98 1476 aa16■□□□□ 0.15
TTLL4-202ENST00000392102 ITGAEP38570 1179 aa16■□□□□ 0.15
TTLL4-202ENST00000392102 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTLL4-202ENST00000392102 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL4-202ENST00000392102 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL4-202ENST00000392102 APLP2Q06481 763 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL4-202ENST00000392102 NEUROD1Q13562 356 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL4-202ENST00000392102 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TTLL4-202ENST00000392102 NACADO15069 1562 aa15.87■□□□□ 0.13
TTLL4-202ENST00000392102 CEP162Q5TB80 1403 aa15.85■□□□□ 0.13
TTLL4-202ENST00000392102 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.85■□□□□ 0.13
TTLL4-202ENST00000392102 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TTLL4-202ENST00000392102 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TTLL4-202ENST00000392102 P3H3Q8IVL6 736 aa15.71■□□□□ 0.11
TTLL4-202ENST00000392102 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TTLL4-202ENST00000392102 MIER1Q8N108 512 aa15.68■□□□□ 0.1
TTLL4-202ENST00000392102 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
TTLL4-202ENST00000392102 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTLL4-202ENST00000392102 SMARCA4P51532 1647 aa15.6■□□□□ 0.09
TTLL4-202ENST00000392102 SMARCA2P51531 1590 aa15.6■□□□□ 0.09
TTLL4-202ENST00000392102 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.58■□□□□ 0.09
TTLL4-202ENST00000392102 CLIP1P30622 1438 aa15.58■□□□□ 0.09
TTLL4-202ENST00000392102 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTLL4-202ENST00000392102 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TTLL4-202ENST00000392102 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TTLL4-202ENST00000392102 GOLGA3Q08378 1498 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL4-202ENST00000392102 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.51■□□□□ 0.07
TTLL4-202ENST00000392102 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTLL4-202ENST00000392102 ARID3CA6NKF2 412 aa15.49■□□□□ 0.07
TTLL4-202ENST00000392102 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTLL4-202ENST00000392102 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TTLL4-202ENST00000392102 BCANQ96GW7 911 aa15.42■□□□□ 0.06
TTLL4-202ENST00000392102 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.41■□□□□ 0.06
TTLL4-202ENST00000392102 SYNJ1O43426 1573 aa15.41■□□□□ 0.06
TTLL4-202ENST00000392102 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TTLL4-202ENST00000392102 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.37■□□□□ 0.05
TTLL4-202ENST00000392102 KCNH8Q96L42 1107 aa15.36■□□□□ 0.05
TTLL4-202ENST00000392102 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.36■□□□□ 0.05
TTLL4-202ENST00000392102 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.33■□□□□ 0.05
TTLL4-202ENST00000392102 FBLN2P98095 1184 aa15.33■□□□□ 0.04
TTLL4-202ENST00000392102 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.32■□□□□ 0.04
TTLL4-202ENST00000392102 EEA1Q15075 1411 aa15.3■□□□□ 0.04
TTLL4-202ENST00000392102 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.3■□□□□ 0.04
TTLL4-202ENST00000392102 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TTLL4-202ENST00000392102 ERCC6Q03468 1493 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL4-202ENST00000392102 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TTLL4-202ENST00000392102 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL4-202ENST00000392102 TRIM52Q96A61 297 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 KIF21BO75037 1637 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 CUX2O14529 1486 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 ARAP1Q96P48 1450 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTLL4-202ENST00000392102 KIF27Q86VH2 1401 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL4-202ENST00000392102 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL4-202ENST00000392102 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL4-202ENST00000392102 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TTLL4-202ENST00000392102 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.07■□□□□ 0
TTLL4-202ENST00000392102 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.06■□□□□ 0
TTLL4-202ENST00000392102 CUX1P39880 1505 aa15.04■□□□□ -0
TTLL4-202ENST00000392102 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.04■□□□□ -0
TTLL4-202ENST00000392102 FKBP8Q14318 412 aa15.03■□□□□ -0
TTLL4-202ENST00000392102 FOXD1Q16676 465 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.7 ms