Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MED16Q9Y2X0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MED16Q9Y2X0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED16Q9Y2X0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED16Q9Y2X0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED16Q9Y2X0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms