Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC3Q9ULS5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCC3Q9ULS5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC3Q9ULS5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC3Q9ULS5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms