Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RCAN3Q9UKA8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RCAN3Q9UKA8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RCAN3Q9UKA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RCAN3Q9UKA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RCAN3Q9UKA8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RCAN3Q9UKA8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RCAN3Q9UKA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RCAN3Q9UKA8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RCAN3Q9UKA8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RCAN3Q9UKA8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms