Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RCAN3Q9UKA8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RCAN3Q9UKA8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RCAN3Q9UKA8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
RCAN3Q9UKA8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RCAN3Q9UKA8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RCAN3Q9UKA8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RCAN3Q9UKA8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RCAN3Q9UKA8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RCAN3Q9UKA8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RCAN3Q9UKA8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RCAN3Q9UKA8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RCAN3Q9UKA8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RCAN3Q9UKA8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RCAN3Q9UKA8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RCAN3Q9UKA8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RCAN3Q9UKA8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RCAN3Q9UKA8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RCAN3Q9UKA8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RCAN3Q9UKA8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RCAN3Q9UKA8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RCAN3Q9UKA8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RCAN3Q9UKA8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RCAN3Q9UKA8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RCAN3Q9UKA8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RCAN3Q9UKA8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RCAN3Q9UKA8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RCAN3Q9UKA8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RCAN3Q9UKA8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RCAN3Q9UKA8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RCAN3Q9UKA8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RCAN3Q9UKA8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RCAN3Q9UKA8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RCAN3Q9UKA8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RCAN3Q9UKA8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RCAN3Q9UKA8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RCAN3Q9UKA8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RCAN3Q9UKA8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RCAN3Q9UKA8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RCAN3Q9UKA8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RCAN3Q9UKA8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RCAN3Q9UKA8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RCAN3Q9UKA8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RCAN3Q9UKA8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RCAN3Q9UKA8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RCAN3Q9UKA8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RCAN3Q9UKA8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
RCAN3Q9UKA8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RCAN3Q9UKA8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RCAN3Q9UKA8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RCAN3Q9UKA8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RCAN3Q9UKA8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RCAN3Q9UKA8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
RCAN3Q9UKA8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RCAN3Q9UKA8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RCAN3Q9UKA8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RCAN3Q9UKA8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RCAN3Q9UKA8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RCAN3Q9UKA8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RCAN3Q9UKA8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RCAN3Q9UKA8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RCAN3Q9UKA8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RCAN3Q9UKA8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RCAN3Q9UKA8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RCAN3Q9UKA8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RCAN3Q9UKA8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RCAN3Q9UKA8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RCAN3Q9UKA8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RCAN3Q9UKA8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RCAN3Q9UKA8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
RCAN3Q9UKA8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RCAN3Q9UKA8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RCAN3Q9UKA8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RCAN3Q9UKA8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RCAN3Q9UKA8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RCAN3Q9UKA8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RCAN3Q9UKA8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RCAN3Q9UKA8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RCAN3Q9UKA8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RCAN3Q9UKA8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RCAN3Q9UKA8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RCAN3Q9UKA8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RCAN3Q9UKA8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RCAN3Q9UKA8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RCAN3Q9UKA8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RCAN3Q9UKA8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RCAN3Q9UKA8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RCAN3Q9UKA8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RCAN3Q9UKA8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RCAN3Q9UKA8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RCAN3Q9UKA8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RCAN3Q9UKA8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RCAN3Q9UKA8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RCAN3Q9UKA8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RCAN3Q9UKA8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RCAN3Q9UKA8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RCAN3Q9UKA8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
RCAN3Q9UKA8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RCAN3Q9UKA8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RCAN3Q9UKA8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms