Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS51Q9UID3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS51Q9UID3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS51Q9UID3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS51Q9UID3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS51Q9UID3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms