Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPR1Q9UBH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPR1Q9UBH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPR1Q9UBH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPR1Q9UBH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPR1Q9UBH6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms