Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GMIPQ9P107 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GMIPQ9P107 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GMIPQ9P107 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GMIPQ9P107 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GMIPQ9P107 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GMIPQ9P107 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GMIPQ9P107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms