Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GMIPQ9P107 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GMIPQ9P107 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GMIPQ9P107 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GMIPQ9P107 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GMIPQ9P107 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GMIPQ9P107 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GMIPQ9P107 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GMIPQ9P107 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GMIPQ9P107 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GMIPQ9P107 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GMIPQ9P107 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GMIPQ9P107 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GMIPQ9P107 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GMIPQ9P107 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GMIPQ9P107 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GMIPQ9P107 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GMIPQ9P107 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GMIPQ9P107 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GMIPQ9P107 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GMIPQ9P107 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GMIPQ9P107 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GMIPQ9P107 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GMIPQ9P107 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GMIPQ9P107 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GMIPQ9P107 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GMIPQ9P107 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GMIPQ9P107 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GMIPQ9P107 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GMIPQ9P107 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GMIPQ9P107 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GMIPQ9P107 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GMIPQ9P107 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GMIPQ9P107 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GMIPQ9P107 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GMIPQ9P107 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GMIPQ9P107 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GMIPQ9P107 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GMIPQ9P107 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GMIPQ9P107 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GMIPQ9P107 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GMIPQ9P107 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GMIPQ9P107 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GMIPQ9P107 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GMIPQ9P107 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GMIPQ9P107 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GMIPQ9P107 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GMIPQ9P107 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GMIPQ9P107 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GMIPQ9P107 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GMIPQ9P107 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GMIPQ9P107 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GMIPQ9P107 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GMIPQ9P107 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GMIPQ9P107 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GMIPQ9P107 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GMIPQ9P107 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GMIPQ9P107 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GMIPQ9P107 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GMIPQ9P107 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GMIPQ9P107 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GMIPQ9P107 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GMIPQ9P107 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GMIPQ9P107 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GMIPQ9P107 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GMIPQ9P107 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GMIPQ9P107 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GMIPQ9P107 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GMIPQ9P107 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GMIPQ9P107 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GMIPQ9P107 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GMIPQ9P107 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GMIPQ9P107 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GMIPQ9P107 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GMIPQ9P107 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GMIPQ9P107 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GMIPQ9P107 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GMIPQ9P107 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GMIPQ9P107 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GMIPQ9P107 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GMIPQ9P107 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GMIPQ9P107 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GMIPQ9P107 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GMIPQ9P107 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GMIPQ9P107 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GMIPQ9P107 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GMIPQ9P107 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GMIPQ9P107 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GMIPQ9P107 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GMIPQ9P107 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GMIPQ9P107 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GMIPQ9P107 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GMIPQ9P107 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GMIPQ9P107 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms