Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2L1Q9P0L9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD2L1Q9P0L9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2L1Q9P0L9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms