Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNQ1DNQ9H478 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1DNQ9H478 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNQ1DNQ9H478 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1DNQ9H478 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms