Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Y6

SRMS, Tyrosine-protein kinase Srms, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMSQ9H3Y6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRMSQ9H3Y6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRMSQ9H3Y6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRMSQ9H3Y6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRMSQ9H3Y6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRMSQ9H3Y6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms