Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUF2Q9BZD4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUF2Q9BZD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUF2Q9BZD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms