Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT27Q9BW83 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT27Q9BW83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT27Q9BW83 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT27Q9BW83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT27Q9BW83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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