Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD7Q9BUK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD7Q9BUK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD7Q9BUK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms