Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAP1L3Q99457 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAP1L3Q99457 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAP1L3Q99457 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAP1L3Q99457 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms