Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERGIC2Q96RQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERGIC2Q96RQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.8 ms