Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC3BQ96NL0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC3BQ96NL0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms