Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF145Q96MT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF145Q96MT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF145Q96MT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF145Q96MT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms