Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170P1Q96L14 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170P1Q96L14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170P1Q96L14 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170P1Q96L14 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170P1Q96L14 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms