Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PERPQ96FX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERPQ96FX8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERPQ96FX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms