Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PERPQ96FX8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PERPQ96FX8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PERPQ96FX8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PERPQ96FX8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PERPQ96FX8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PERPQ96FX8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PERPQ96FX8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PERPQ96FX8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PERPQ96FX8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PERPQ96FX8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PERPQ96FX8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PERPQ96FX8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PERPQ96FX8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PERPQ96FX8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PERPQ96FX8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PERPQ96FX8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PERPQ96FX8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PERPQ96FX8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PERPQ96FX8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PERPQ96FX8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PERPQ96FX8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PERPQ96FX8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PERPQ96FX8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PERPQ96FX8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PERPQ96FX8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERPQ96FX8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PERPQ96FX8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PERPQ96FX8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PERPQ96FX8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PERPQ96FX8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PERPQ96FX8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PERPQ96FX8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PERPQ96FX8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PERPQ96FX8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PERPQ96FX8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PERPQ96FX8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PERPQ96FX8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PERPQ96FX8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PERPQ96FX8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PERPQ96FX8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PERPQ96FX8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PERPQ96FX8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERPQ96FX8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PERPQ96FX8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PERPQ96FX8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PERPQ96FX8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PERPQ96FX8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PERPQ96FX8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PERPQ96FX8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PERPQ96FX8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PERPQ96FX8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PERPQ96FX8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PERPQ96FX8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PERPQ96FX8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PERPQ96FX8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PERPQ96FX8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PERPQ96FX8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PERPQ96FX8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PERPQ96FX8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PERPQ96FX8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PERPQ96FX8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PERPQ96FX8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PERPQ96FX8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERPQ96FX8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERPQ96FX8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PERPQ96FX8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PERPQ96FX8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PERPQ96FX8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PERPQ96FX8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERPQ96FX8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERPQ96FX8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERPQ96FX8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERPQ96FX8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PERPQ96FX8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PERPQ96FX8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERPQ96FX8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERPQ96FX8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PERPQ96FX8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERPQ96FX8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PERPQ96FX8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PERPQ96FX8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PERPQ96FX8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERPQ96FX8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERPQ96FX8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PERPQ96FX8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PERPQ96FX8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PERPQ96FX8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PERPQ96FX8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms