Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L3HYPDHQ96EM0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L3HYPDHQ96EM0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L3HYPDHQ96EM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms