Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A1Q8WWI5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A1Q8WWI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC44A1Q8WWI5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC44A1Q8WWI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A1Q8WWI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A1Q8WWI5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A1Q8WWI5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms