Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF4Q8WWF5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNRF4Q8WWF5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF4Q8WWF5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms