Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNRF4Q8WWF5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNRF4Q8WWF5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNRF4Q8WWF5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF4Q8WWF5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNRF4Q8WWF5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF4Q8WWF5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF4Q8WWF5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNRF4Q8WWF5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNRF4Q8WWF5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF4Q8WWF5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF4Q8WWF5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNRF4Q8WWF5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNRF4Q8WWF5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNRF4Q8WWF5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNRF4Q8WWF5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNRF4Q8WWF5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF4Q8WWF5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF4Q8WWF5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF4Q8WWF5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF4Q8WWF5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNRF4Q8WWF5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF4Q8WWF5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF4Q8WWF5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF4Q8WWF5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF4Q8WWF5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF4Q8WWF5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF4Q8WWF5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNRF4Q8WWF5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNRF4Q8WWF5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF4Q8WWF5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF4Q8WWF5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNRF4Q8WWF5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF4Q8WWF5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF4Q8WWF5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNRF4Q8WWF5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF4Q8WWF5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF4Q8WWF5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF4Q8WWF5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF4Q8WWF5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF4Q8WWF5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF4Q8WWF5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNRF4Q8WWF5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF4Q8WWF5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF4Q8WWF5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF4Q8WWF5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF4Q8WWF5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF4Q8WWF5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF4Q8WWF5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF4Q8WWF5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF4Q8WWF5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF4Q8WWF5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF4Q8WWF5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF4Q8WWF5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF4Q8WWF5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF4Q8WWF5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF4Q8WWF5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF4Q8WWF5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNRF4Q8WWF5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF4Q8WWF5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF4Q8WWF5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNRF4Q8WWF5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF4Q8WWF5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF4Q8WWF5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF4Q8WWF5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF4Q8WWF5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF4Q8WWF5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF4Q8WWF5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF4Q8WWF5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF4Q8WWF5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF4Q8WWF5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF4Q8WWF5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF4Q8WWF5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF4Q8WWF5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF4Q8WWF5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF4Q8WWF5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF4Q8WWF5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF4Q8WWF5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF4Q8WWF5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF4Q8WWF5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF4Q8WWF5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF4Q8WWF5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF4Q8WWF5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF4Q8WWF5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF4Q8WWF5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF4Q8WWF5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF4Q8WWF5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF4Q8WWF5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNRF4Q8WWF5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF4Q8WWF5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms