Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GIPC3Q8TF64 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIPC3Q8TF64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC3Q8TF64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms