Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS1Q8NFJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS1Q8NFJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS1Q8NFJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS1Q8NFJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS1Q8NFJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms