Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BBS1Q8NFJ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBS1Q8NFJ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBS1Q8NFJ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBS1Q8NFJ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BBS1Q8NFJ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BBS1Q8NFJ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBS1Q8NFJ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BBS1Q8NFJ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BBS1Q8NFJ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BBS1Q8NFJ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBS1Q8NFJ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBS1Q8NFJ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBS1Q8NFJ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBS1Q8NFJ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBS1Q8NFJ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBS1Q8NFJ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBS1Q8NFJ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBS1Q8NFJ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBS1Q8NFJ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBS1Q8NFJ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBS1Q8NFJ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BBS1Q8NFJ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BBS1Q8NFJ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBS1Q8NFJ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBS1Q8NFJ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBS1Q8NFJ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBS1Q8NFJ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBS1Q8NFJ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BBS1Q8NFJ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BBS1Q8NFJ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BBS1Q8NFJ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBS1Q8NFJ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBS1Q8NFJ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBS1Q8NFJ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS1Q8NFJ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBS1Q8NFJ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBS1Q8NFJ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS1Q8NFJ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBS1Q8NFJ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBS1Q8NFJ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBS1Q8NFJ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBS1Q8NFJ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBS1Q8NFJ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBS1Q8NFJ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBS1Q8NFJ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBS1Q8NFJ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBS1Q8NFJ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBS1Q8NFJ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBS1Q8NFJ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBS1Q8NFJ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBS1Q8NFJ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBS1Q8NFJ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBS1Q8NFJ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS1Q8NFJ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBS1Q8NFJ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS1Q8NFJ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS1Q8NFJ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBS1Q8NFJ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS1Q8NFJ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS1Q8NFJ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS1Q8NFJ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS1Q8NFJ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBS1Q8NFJ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS1Q8NFJ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS1Q8NFJ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BBS1Q8NFJ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS1Q8NFJ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS1Q8NFJ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS1Q8NFJ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS1Q8NFJ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS1Q8NFJ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS1Q8NFJ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS1Q8NFJ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBS1Q8NFJ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS1Q8NFJ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BBS1Q8NFJ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS1Q8NFJ9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBS1Q8NFJ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS1Q8NFJ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBS1Q8NFJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBS1Q8NFJ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBS1Q8NFJ9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS1Q8NFJ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS1Q8NFJ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BBS1Q8NFJ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS1Q8NFJ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS1Q8NFJ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBS1Q8NFJ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS1Q8NFJ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS1Q8NFJ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS1Q8NFJ9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BBS1Q8NFJ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS1Q8NFJ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS1Q8NFJ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms