Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A4Q8NFF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC24A4Q8NFF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC24A4Q8NFF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms