Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms