Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD4Q6ZMP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THSD4Q6ZMP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD4Q6ZMP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms