Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SLC9C2Q5TAH2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SLC9C2Q5TAH2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC9C2Q5TAH2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC9C2Q5TAH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC9C2Q5TAH2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms