Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SLC9C2Q5TAH2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
SLC9C2Q5TAH2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SLC9C2Q5TAH2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
SLC9C2Q5TAH2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLC9C2Q5TAH2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SLC9C2Q5TAH2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SLC9C2Q5TAH2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SLC9C2Q5TAH2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SLC9C2Q5TAH2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SLC9C2Q5TAH2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SLC9C2Q5TAH2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SLC9C2Q5TAH2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SLC9C2Q5TAH2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SLC9C2Q5TAH2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SLC9C2Q5TAH2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SLC9C2Q5TAH2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SLC9C2Q5TAH2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SLC9C2Q5TAH2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SLC9C2Q5TAH2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLC9C2Q5TAH2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SLC9C2Q5TAH2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SLC9C2Q5TAH2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SLC9C2Q5TAH2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SLC9C2Q5TAH2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SLC9C2Q5TAH2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SLC9C2Q5TAH2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SLC9C2Q5TAH2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SLC9C2Q5TAH2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC9C2Q5TAH2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SLC9C2Q5TAH2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC9C2Q5TAH2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC9C2Q5TAH2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SLC9C2Q5TAH2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC9C2Q5TAH2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SLC9C2Q5TAH2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SLC9C2Q5TAH2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC9C2Q5TAH2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC9C2Q5TAH2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SLC9C2Q5TAH2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC9C2Q5TAH2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC9C2Q5TAH2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLC9C2Q5TAH2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLC9C2Q5TAH2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC9C2Q5TAH2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SLC9C2Q5TAH2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLC9C2Q5TAH2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLC9C2Q5TAH2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SLC9C2Q5TAH2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC9C2Q5TAH2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SLC9C2Q5TAH2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC9C2Q5TAH2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC9C2Q5TAH2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC9C2Q5TAH2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SLC9C2Q5TAH2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SLC9C2Q5TAH2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLC9C2Q5TAH2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SLC9C2Q5TAH2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SLC9C2Q5TAH2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SLC9C2Q5TAH2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SLC9C2Q5TAH2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SLC9C2Q5TAH2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SLC9C2Q5TAH2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SLC9C2Q5TAH2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SLC9C2Q5TAH2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SLC9C2Q5TAH2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SLC9C2Q5TAH2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SLC9C2Q5TAH2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SLC9C2Q5TAH2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SLC9C2Q5TAH2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SLC9C2Q5TAH2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SLC9C2Q5TAH2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
SLC9C2Q5TAH2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SLC9C2Q5TAH2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SLC9C2Q5TAH2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SLC9C2Q5TAH2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SLC9C2Q5TAH2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SLC9C2Q5TAH2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SLC9C2Q5TAH2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SLC9C2Q5TAH2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SLC9C2Q5TAH2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SLC9C2Q5TAH2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SLC9C2Q5TAH2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLC9C2Q5TAH2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SLC9C2Q5TAH2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SLC9C2Q5TAH2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SLC9C2Q5TAH2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SLC9C2Q5TAH2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SLC9C2Q5TAH2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SLC9C2Q5TAH2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLC9C2Q5TAH2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SLC9C2Q5TAH2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms