Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC158Q5M9N0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC158Q5M9N0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC158Q5M9N0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC158Q5M9N0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC158Q5M9N0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC158Q5M9N0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms