Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC158Q5M9N0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC158Q5M9N0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC158Q5M9N0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC158Q5M9N0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC158Q5M9N0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC158Q5M9N0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC158Q5M9N0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC158Q5M9N0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC158Q5M9N0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC158Q5M9N0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC158Q5M9N0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC158Q5M9N0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC158Q5M9N0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC158Q5M9N0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC158Q5M9N0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC158Q5M9N0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC158Q5M9N0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC158Q5M9N0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CCDC158Q5M9N0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC158Q5M9N0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC158Q5M9N0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC158Q5M9N0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC158Q5M9N0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC158Q5M9N0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC158Q5M9N0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC158Q5M9N0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC158Q5M9N0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC158Q5M9N0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC158Q5M9N0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC158Q5M9N0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC158Q5M9N0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC158Q5M9N0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC158Q5M9N0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC158Q5M9N0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC158Q5M9N0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC158Q5M9N0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC158Q5M9N0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC158Q5M9N0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC158Q5M9N0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC158Q5M9N0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC158Q5M9N0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC158Q5M9N0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC158Q5M9N0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC158Q5M9N0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC158Q5M9N0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC158Q5M9N0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC158Q5M9N0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC158Q5M9N0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC158Q5M9N0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC158Q5M9N0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC158Q5M9N0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC158Q5M9N0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC158Q5M9N0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC158Q5M9N0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC158Q5M9N0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC158Q5M9N0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC158Q5M9N0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC158Q5M9N0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC158Q5M9N0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC158Q5M9N0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC158Q5M9N0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC158Q5M9N0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC158Q5M9N0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC158Q5M9N0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC158Q5M9N0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC158Q5M9N0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC158Q5M9N0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC158Q5M9N0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC158Q5M9N0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC158Q5M9N0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC158Q5M9N0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CCDC158Q5M9N0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC158Q5M9N0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC158Q5M9N0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC158Q5M9N0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC158Q5M9N0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC158Q5M9N0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC158Q5M9N0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC158Q5M9N0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC158Q5M9N0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC158Q5M9N0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC158Q5M9N0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC158Q5M9N0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC158Q5M9N0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC158Q5M9N0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC158Q5M9N0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC158Q5M9N0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC158Q5M9N0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC158Q5M9N0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC158Q5M9N0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC158Q5M9N0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC158Q5M9N0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC158Q5M9N0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC158Q5M9N0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC158Q5M9N0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC158Q5M9N0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC158Q5M9N0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms