Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPE65Q16518 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPE65Q16518 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPE65Q16518 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPE65Q16518 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPE65Q16518 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPE65Q16518 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPE65Q16518 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPE65Q16518 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPE65Q16518 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPE65Q16518 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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