Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA6Q16445 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA6Q16445 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA6Q16445 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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