Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GABRA6Q16445 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABRA6Q16445 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GABRA6Q16445 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABRA6Q16445 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GABRA6Q16445 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GABRA6Q16445 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GABRA6Q16445 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABRA6Q16445 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABRA6Q16445 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABRA6Q16445 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRA6Q16445 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRA6Q16445 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRA6Q16445 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRA6Q16445 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRA6Q16445 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRA6Q16445 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRA6Q16445 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRA6Q16445 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GABRA6Q16445 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRA6Q16445 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRA6Q16445 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRA6Q16445 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRA6Q16445 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRA6Q16445 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRA6Q16445 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRA6Q16445 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRA6Q16445 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRA6Q16445 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRA6Q16445 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRA6Q16445 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABRA6Q16445 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRA6Q16445 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABRA6Q16445 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRA6Q16445 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRA6Q16445 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRA6Q16445 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRA6Q16445 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRA6Q16445 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRA6Q16445 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRA6Q16445 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRA6Q16445 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRA6Q16445 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRA6Q16445 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRA6Q16445 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRA6Q16445 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRA6Q16445 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRA6Q16445 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRA6Q16445 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRA6Q16445 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRA6Q16445 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRA6Q16445 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRA6Q16445 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRA6Q16445 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRA6Q16445 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRA6Q16445 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRA6Q16445 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA6Q16445 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRA6Q16445 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRA6Q16445 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRA6Q16445 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA6Q16445 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRA6Q16445 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRA6Q16445 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRA6Q16445 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRA6Q16445 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRA6Q16445 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRA6Q16445 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRA6Q16445 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRA6Q16445 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRA6Q16445 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRA6Q16445 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRA6Q16445 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA6Q16445 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GABRA6Q16445 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRA6Q16445 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRA6Q16445 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA6Q16445 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRA6Q16445 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRA6Q16445 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRA6Q16445 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA6Q16445 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA6Q16445 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA6Q16445 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRA6Q16445 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRA6Q16445 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA6Q16445 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRA6Q16445 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA6Q16445 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRA6Q16445 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA6Q16445 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA6Q16445 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA6Q16445 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA6Q16445 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA6Q16445 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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