Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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