Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPHQ15003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPHQ15003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPHQ15003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPHQ15003 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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