Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 27.67□□□□□ -1.188e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.338e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.368e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.448e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.688e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 CRNDE-209ENST00000560208 735 ntTSL 222.12■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 CRNDE-203ENST00000557792 481 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 SRRM1-206ENST00000466910 799 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NLRP1-209ENST00000572143 578 ntTSL 410.55□□□□□ -0.727e-11■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 215.92■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 SCART1-204ENST00000482993 4904 ntTSL 215.73■□□□□ 0.118e-8■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 SCART1-202ENST00000463137 4756 ntTSL 215.33■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-11■■■■■ 27.3
SRSF1Q07955 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 518.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-9■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 511.37□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 210.71□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 27.2
SRSF1Q07955 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 27.1
SRSF1Q07955 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.18■□□□□ 0.665e-9■■■■■ 27.1
SRSF1Q07955 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.27□□□□□ -1.894e-9■■■■■ 27.1
SRSF1Q07955 WDR73-214ENST00000560088 526 ntTSL 39.15□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 27.1
SRSF1Q07955 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 318.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 PSMA1-206ENST00000528018 479 ntTSL 215.59■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 515.39■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 KIF22-205ENST00000563666 1603 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 KIF22-210ENST00000570173 562 ntTSL 514.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 213.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 212.47□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 PPAN-203ENST00000430370 594 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.05□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 TTC37-209ENST00000510228 511 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 25.11□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 ASNS-213ENST00000454046 1947 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-204ENST00000461327 580 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-209ENST00000491447 644 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-203ENST00000459969 787 ntTSL 211.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-212ENST00000615152 3434 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 27
SRSF1Q07955 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 CWC22-201ENST00000404136 2392 ntTSL 1 (best)5.05□□□□□ -1.67e-8■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 TOP3A-218ENST00000584669 580 ntTSL 419.7■□□□□ 0.748e-9■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.628e-9■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 UBTF-210ENST00000529947 685 ntTSL 36.88□□□□□ -1.318e-9■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 CREBZF-206ENST00000528561 1099 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 514.13□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 55.4□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 26.9
SRSF1Q07955 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 26.8
SRSF1Q07955 CRNDE-205ENST00000558952 600 ntTSL 420.23■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 26.7
SRSF1Q07955 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 26.7
SRSF1Q07955 CRNDE-202ENST00000502066 659 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 26.7
SRSF1Q07955 HERPUD1-215ENST00000568676 571 ntTSL 215.79■□□□□ 0.125e-9■■■■□ 26.7
SRSF1Q07955 HERPUD1-205ENST00000562914 570 ntTSL 215.79■□□□□ 0.125e-9■■■■□ 26.7
SRSF1Q07955 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 THOP1-214ENST00000592639 431 ntTSL 314.92□□□□□ -0.023e-16■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-213ENST00000472155 2646 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-216ENST00000496466 2339 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-215ENST00000494942 2325 ntTSL 211.36□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 UBXN11-214ENST00000475591 2542 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 RBM12B-206ENST00000520961 507 ntTSL 36.28□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 522.13■■□□□ 1.138e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-204ENST00000456665 577 ntTSL 522.13■■□□□ 1.138e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-207ENST00000538037 631 ntTSL 521.77■■□□□ 1.088e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-211ENST00000544662 836 ntTSL 320.36■□□□□ 0.858e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.688e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.42■□□□□ 0.548e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 318.35■□□□□ 0.538e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.148e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.368e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.548e-8■■■■□ 26.6
SRSF1Q07955 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 26.5
SRSF1Q07955 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 26.5
SRSF1Q07955 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 26.5
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 317.7 ms