RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535067.5

PUS1-205, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PUS1, Length 838 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-205ENST00000535067 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.54■■■■■ 4.24
PUS1-205ENST00000535067 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.22■■■■□ 3.55
PUS1-205ENST00000535067 ABCC9O60706 1549 aa36.79■■■■□ 3.48
PUS1-205ENST00000535067 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.21■■■■□ 3.23
PUS1-205ENST00000535067 NACADO15069 1562 aa35.04■■■■□ 3.2
PUS1-205ENST00000535067 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.74■■■■□ 3.15
PUS1-205ENST00000535067 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
PUS1-205ENST00000535067 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.54■■■■□ 3.12
PUS1-205ENST00000535067 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
PUS1-205ENST00000535067 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.35■■■■□ 3.09
PUS1-205ENST00000535067 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.07
PUS1-205ENST00000535067 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.19■■■■□ 3.06
PUS1-205ENST00000535067 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.13■■■■□ 3.05
PUS1-205ENST00000535067 SCRIBQ14160 1630 aa33.9■■■■□ 3.02
PUS1-205ENST00000535067 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.75■■■□□ 2.99
PUS1-205ENST00000535067 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
PUS1-205ENST00000535067 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.31■■■□□ 2.92
PUS1-205ENST00000535067 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
PUS1-205ENST00000535067 SMARCA4P51532 1647 aa32.38■■■□□ 2.77
PUS1-205ENST00000535067 NCAPD3P42695 1498 aa32.29■■■□□ 2.76
PUS1-205ENST00000535067 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.26■■■□□ 2.75
PUS1-205ENST00000535067 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
PUS1-205ENST00000535067 SMARCA2P51531 1590 aa32.21■■■□□ 2.75
PUS1-205ENST00000535067 HMGXB3Q12766 1538 aa32.16■■■□□ 2.74
PUS1-205ENST00000535067 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.06■■■□□ 2.72
PUS1-205ENST00000535067 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.02■■■□□ 2.72
PUS1-205ENST00000535067 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
PUS1-205ENST00000535067 ERCC6Q03468 1493 aa31.73■■■□□ 2.67
PUS1-205ENST00000535067 NESP48681 1621 aa31.71■■■□□ 2.67
PUS1-205ENST00000535067 WIZO95785 1651 aa31.69■■■□□ 2.66
PUS1-205ENST00000535067 CUX2O14529 1486 aa31.59■■■□□ 2.65
PUS1-205ENST00000535067 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.57■■■□□ 2.64
PUS1-205ENST00000535067 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
PUS1-205ENST00000535067 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.41■■■□□ 2.62
PUS1-205ENST00000535067 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
PUS1-205ENST00000535067 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
PUS1-205ENST00000535067 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.3■■■□□ 2.6
PUS1-205ENST00000535067 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.3■■■□□ 2.6
PUS1-205ENST00000535067 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.08■■■□□ 2.57
PUS1-205ENST00000535067 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.07■■■□□ 2.56
PUS1-205ENST00000535067 CFTRP13569 1480 aa31.06■■■□□ 2.56
PUS1-205ENST00000535067 WDR62O43379 1518 aa31.02■■■□□ 2.56
PUS1-205ENST00000535067 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.01■■■□□ 2.56
PUS1-205ENST00000535067 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.99■■■□□ 2.55
PUS1-205ENST00000535067 PRDM2Q13029 1718 aa30.95■■■□□ 2.54
PUS1-205ENST00000535067 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.88■■■□□ 2.53
PUS1-205ENST00000535067 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PUS1-205ENST00000535067 TOPBP1Q92547 1522 aa30.46■■■□□ 2.47
PUS1-205ENST00000535067 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.41■■■□□ 2.46
PUS1-205ENST00000535067 ABCC8Q09428 1581 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-205ENST00000535067 IFT140Q96RY7 1462 aa30.36■■■□□ 2.45
PUS1-205ENST00000535067 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PUS1-205ENST00000535067 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
PUS1-205ENST00000535067 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PUS1-205ENST00000535067 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PUS1-205ENST00000535067 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PUS1-205ENST00000535067 CUX1P39880 1505 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-205ENST00000535067 OSCARQ8IYS5 282 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-205ENST00000535067 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-205ENST00000535067 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-205ENST00000535067 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.49e-7■■■■■ 27.5
PUS1-205ENST00000535067 SOGA1O94964 1423 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-205ENST00000535067 CHD1O14646 1710 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-205ENST00000535067 WDR97A6NE52 1622 aa29.93■■■□□ 2.38
PUS1-205ENST00000535067 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PUS1-205ENST00000535067 TRIM41Q8WV44 630 aa29.86■■■□□ 2.37
PUS1-205ENST00000535067 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-205ENST00000535067 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-205ENST00000535067 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-205ENST00000535067 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.78■■■□□ 2.36
PUS1-205ENST00000535067 PBRM1Q86U86 1689 aa29.76■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.74■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 ARHGEF11O15085 1522 aa29.73■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 GRIN2BQ13224 1484 aa29.71■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.71■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.71■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
PUS1-205ENST00000535067 TOP2BQ02880 1626 aa29.7■■■□□ 2.34
PUS1-205ENST00000535067 SYNJ1O43426 1573 aa29.69■■■□□ 2.34
PUS1-205ENST00000535067 FBLN2P98095 1184 aa29.68■■■□□ 2.34
PUS1-205ENST00000535067 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.65■■■□□ 2.34
PUS1-205ENST00000535067 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
PUS1-205ENST00000535067 SYNJ2O15056 1496 aa29.59■■■□□ 2.33
PUS1-205ENST00000535067 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.57■■■□□ 2.32
PUS1-205ENST00000535067 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PUS1-205ENST00000535067 ARAP1Q96P48 1450 aa29.46■■■□□ 2.31
PUS1-205ENST00000535067 ADAMTS12P58397 1594 aa29.45■■■□□ 2.31
PUS1-205ENST00000535067 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.36■■■□□ 2.29
PUS1-205ENST00000535067 GRIN2AQ12879 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
PUS1-205ENST00000535067 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
PUS1-205ENST00000535067 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.28■■■□□ 2.28
PUS1-205ENST00000535067 CEP170Q5SW79 1584 aa29.28■■■□□ 2.28
PUS1-205ENST00000535067 NUP160Q12769 1436 aa29.24■■■□□ 2.27
PUS1-205ENST00000535067 SHROOM2Q13796 1616 aa29.14■■■□□ 2.26
PUS1-205ENST00000535067 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.13■■■□□ 2.25
PUS1-205ENST00000535067 KIF27Q86VH2 1401 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-205ENST00000535067 CUL7Q14999 1698 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-205ENST00000535067 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-205ENST00000535067 IGF1RP08069 1367 aa28.97■■■□□ 2.23
PUS1-205ENST00000535067 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms