RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.47■■■■■ 6.15
PUS1-211ENST00000544662 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.63■■■■■ 5.22
PUS1-211ENST00000544662 ABCC9O60706 1549 aa46.81■■■■■ 5.08
PUS1-211ENST00000544662 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.92■■■■■ 4.78
PUS1-211ENST00000544662 NACADO15069 1562 aa44.82■■■■■ 4.76
PUS1-211ENST00000544662 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.76■■■■■ 4.76
PUS1-211ENST00000544662 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
PUS1-211ENST00000544662 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.46■■■■■ 4.71
PUS1-211ENST00000544662 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.21■■■■■ 4.67
PUS1-211ENST00000544662 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.95■■■■■ 4.63
PUS1-211ENST00000544662 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.7■■■■■ 4.59
PUS1-211ENST00000544662 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.58■■■■■ 4.57
PUS1-211ENST00000544662 SCRIBQ14160 1630 aa43.47■■■■■ 4.55
PUS1-211ENST00000544662 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.14■■■■■ 4.5
PUS1-211ENST00000544662 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.06■■■■■ 4.48
PUS1-211ENST00000544662 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.39
PUS1-211ENST00000544662 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.33■■■■■ 4.37
PUS1-211ENST00000544662 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.06■■■■■ 4.32
PUS1-211ENST00000544662 SMARCA4P51532 1647 aa41.55■■■■■ 4.24
PUS1-211ENST00000544662 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PUS1-211ENST00000544662 NCAPD3P42695 1498 aa41.35■■■■■ 4.21
PUS1-211ENST00000544662 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.35■■■■■ 4.21
PUS1-211ENST00000544662 SMARCA2P51531 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
PUS1-211ENST00000544662 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.22■■■■■ 4.19
PUS1-211ENST00000544662 HMGXB3Q12766 1538 aa41.13■■■■■ 4.18
PUS1-211ENST00000544662 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.12■■■■■ 4.17
PUS1-211ENST00000544662 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PUS1-211ENST00000544662 WIZO95785 1651 aa40.78■■■■■ 4.12
PUS1-211ENST00000544662 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
PUS1-211ENST00000544662 NESP48681 1621 aa40.45■■■■■ 4.07
PUS1-211ENST00000544662 ERCC6Q03468 1493 aa40.34■■■■■ 4.05
PUS1-211ENST00000544662 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
PUS1-211ENST00000544662 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.3■■■■■ 4.04
PUS1-211ENST00000544662 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.13■■■■■ 4.02
PUS1-211ENST00000544662 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.01■■■■■ 4
PUS1-211ENST00000544662 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.99■■■■□ 3.99
PUS1-211ENST00000544662 CUX2O14529 1486 aa39.97■■■■□ 3.99
PUS1-211ENST00000544662 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
PUS1-211ENST00000544662 CFTRP13569 1480 aa39.86■■■■□ 3.97
PUS1-211ENST00000544662 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.85■■■■□ 3.97
PUS1-211ENST00000544662 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.69■■■■□ 3.94
PUS1-211ENST00000544662 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.65■■■■□ 3.94
PUS1-211ENST00000544662 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.64■■■■□ 3.94
PUS1-211ENST00000544662 PRDM2Q13029 1718 aa39.59■■■■□ 3.93
PUS1-211ENST00000544662 WDR62O43379 1518 aa39.51■■■■□ 3.92
PUS1-211ENST00000544662 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
PUS1-211ENST00000544662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
PUS1-211ENST00000544662 TOPBP1Q92547 1522 aa39.04■■■■□ 3.84
PUS1-211ENST00000544662 ABCC8Q09428 1581 aa39■■■■□ 3.83
PUS1-211ENST00000544662 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.98■■■■□ 3.83
PUS1-211ENST00000544662 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.98■■■■□ 3.83
PUS1-211ENST00000544662 IFT140Q96RY7 1462 aa38.83■■■■□ 3.81
PUS1-211ENST00000544662 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
PUS1-211ENST00000544662 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
PUS1-211ENST00000544662 CUX1P39880 1505 aa38.68■■■■□ 3.78
PUS1-211ENST00000544662 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
PUS1-211ENST00000544662 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
PUS1-211ENST00000544662 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.54■■■■□ 3.76
PUS1-211ENST00000544662 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
PUS1-211ENST00000544662 SOGA1O94964 1423 aa38.53■■■■□ 3.76
PUS1-211ENST00000544662 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.755e-8■■■■□ 24.5
PUS1-211ENST00000544662 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.73
PUS1-211ENST00000544662 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
PUS1-211ENST00000544662 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.3■■■■□ 3.72
PUS1-211ENST00000544662 SYNJ1O43426 1573 aa38.29■■■■□ 3.72
PUS1-211ENST00000544662 OSCARQ8IYS5 282 aa38.29■■■■□ 3.72
PUS1-211ENST00000544662 WDR97A6NE52 1622 aa38.29■■■■□ 3.72
PUS1-211ENST00000544662 TOP2BQ02880 1626 aa38.29■■■■□ 3.72
PUS1-211ENST00000544662 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.18■■■■□ 3.7
PUS1-211ENST00000544662 CHD1O14646 1710 aa38.11■■■■□ 3.69
PUS1-211ENST00000544662 GRIN2BQ13224 1484 aa38.09■■■■□ 3.69
PUS1-211ENST00000544662 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.08■■■■□ 3.69
PUS1-211ENST00000544662 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.08■■■■□ 3.69
PUS1-211ENST00000544662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.06■■■■□ 3.68
PUS1-211ENST00000544662 PBRM1Q86U86 1689 aa38.04■■■■□ 3.68
PUS1-211ENST00000544662 FBLN2P98095 1184 aa38.02■■■■□ 3.68
PUS1-211ENST00000544662 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
PUS1-211ENST00000544662 SYNJ2O15056 1496 aa37.88■■■■□ 3.65
PUS1-211ENST00000544662 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
PUS1-211ENST00000544662 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.72■■■■□ 3.63
PUS1-211ENST00000544662 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.72■■■■□ 3.63
PUS1-211ENST00000544662 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.72■■■■□ 3.63
PUS1-211ENST00000544662 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.72■■■■□ 3.63
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTS12P58397 1594 aa37.71■■■■□ 3.63
PUS1-211ENST00000544662 ARHGEF11O15085 1522 aa37.68■■■■□ 3.62
PUS1-211ENST00000544662 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.66■■■■□ 3.62
PUS1-211ENST00000544662 TRIM41Q8WV44 630 aa37.64■■■■□ 3.62
PUS1-211ENST00000544662 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.62■■■■□ 3.61
PUS1-211ENST00000544662 GRIN2AQ12879 1464 aa37.61■■■■□ 3.61
PUS1-211ENST00000544662 KIF27Q86VH2 1401 aa37.55■■■■□ 3.6
PUS1-211ENST00000544662 CEP170Q5SW79 1584 aa37.45■■■■□ 3.59
PUS1-211ENST00000544662 NUP160Q12769 1436 aa37.44■■■■□ 3.58
PUS1-211ENST00000544662 IGF1RP08069 1367 aa37.43■■■■□ 3.58
PUS1-211ENST00000544662 ARAP1Q96P48 1450 aa37.37■■■■□ 3.57
PUS1-211ENST00000544662 CUL7Q14999 1698 aa37.35■■■■□ 3.57
PUS1-211ENST00000544662 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.34■■■■□ 3.57
PUS1-211ENST00000544662 SHROOM2Q13796 1616 aa37.21■■■■□ 3.55
PUS1-211ENST00000544662 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.2■■■■□ 3.55
PUS1-211ENST00000544662 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.19■■■■□ 3.54
PUS1-211ENST00000544662 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.15■■■■□ 3.54
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