RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560208.1

CRNDE-209, Transcript of colorectal neoplasia differentially expressed, humanhuman

TSL 2

Gene CRNDE, Length 735 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNDE-209ENST00000560208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.41■■■■■ 6.78
CRNDE-209ENST00000560208 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.34■■■■■ 5.81
CRNDE-209ENST00000560208 ABCC9O60706 1549 aa50.91■■■■■ 5.74
CRNDE-209ENST00000560208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.66■■■■■ 5.38
CRNDE-209ENST00000560208 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
CRNDE-209ENST00000560208 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.33■■■■■ 5.33
CRNDE-209ENST00000560208 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.89■■■■■ 5.26
CRNDE-209ENST00000560208 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
CRNDE-209ENST00000560208 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.6■■■■■ 5.21
CRNDE-209ENST00000560208 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
CRNDE-209ENST00000560208 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.45■■■■■ 5.19
CRNDE-209ENST00000560208 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.37■■■■■ 5.17
CRNDE-209ENST00000560208 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.21■■■■■ 5.15
CRNDE-209ENST00000560208 SCRIBQ14160 1630 aa46.81■■■■■ 5.08
CRNDE-209ENST00000560208 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.6■■■■■ 5.05
CRNDE-209ENST00000560208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.02■■■■■ 4.96
CRNDE-209ENST00000560208 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
CRNDE-209ENST00000560208 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
CRNDE-209ENST00000560208 SMARCA4P51532 1647 aa44.7■■■■■ 4.75
CRNDE-209ENST00000560208 NCAPD3P42695 1498 aa44.7■■■■■ 4.75
CRNDE-209ENST00000560208 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.63■■■■■ 4.73
CRNDE-209ENST00000560208 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
CRNDE-209ENST00000560208 SMARCA2P51531 1590 aa44.53■■■■■ 4.72
CRNDE-209ENST00000560208 HMGXB3Q12766 1538 aa44.4■■■■■ 4.7
CRNDE-209ENST00000560208 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
CRNDE-209ENST00000560208 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.25■■■■■ 4.67
CRNDE-209ENST00000560208 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
CRNDE-209ENST00000560208 ERCC6Q03468 1493 aa43.92■■■■■ 4.62
CRNDE-209ENST00000560208 NESP48681 1621 aa43.86■■■■■ 4.61
CRNDE-209ENST00000560208 WIZO95785 1651 aa43.76■■■■■ 4.6
CRNDE-209ENST00000560208 CUX2O14529 1486 aa43.68■■■■■ 4.58
CRNDE-209ENST00000560208 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.63■■■■■ 4.57
CRNDE-209ENST00000560208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CRNDE-209ENST00000560208 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.37■■■■■ 4.53
CRNDE-209ENST00000560208 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.37■■■■■ 4.53
CRNDE-209ENST00000560208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.33■■■■■ 4.53
CRNDE-209ENST00000560208 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
CRNDE-209ENST00000560208 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
CRNDE-209ENST00000560208 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.18■■■■■ 4.5
CRNDE-209ENST00000560208 CFTRP13569 1480 aa42.95■■■■■ 4.47
CRNDE-209ENST00000560208 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.95■■■■■ 4.47
CRNDE-209ENST00000560208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.87■■■■■ 4.45
CRNDE-209ENST00000560208 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.87■■■■■ 4.45
CRNDE-209ENST00000560208 WDR62O43379 1518 aa42.82■■■■■ 4.45
CRNDE-209ENST00000560208 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.74■■■■■ 4.43
CRNDE-209ENST00000560208 PRDM2Q13029 1718 aa42.61■■■■■ 4.41
CRNDE-209ENST00000560208 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
CRNDE-209ENST00000560208 TOPBP1Q92547 1522 aa42.11■■■■■ 4.33
CRNDE-209ENST00000560208 ABCC8Q09428 1581 aa42.06■■■■■ 4.32
CRNDE-209ENST00000560208 IFT140Q96RY7 1462 aa42■■■■■ 4.31
CRNDE-209ENST00000560208 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.99■■■■■ 4.31
CRNDE-209ENST00000560208 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
CRNDE-209ENST00000560208 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
CRNDE-209ENST00000560208 OSCARQ8IYS5 282 aa41.8■■■■■ 4.28
CRNDE-209ENST00000560208 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
CRNDE-209ENST00000560208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CRNDE-209ENST00000560208 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CRNDE-209ENST00000560208 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.252e-8■■■■□ 22.7
CRNDE-209ENST00000560208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.55■■■■■ 4.24
CRNDE-209ENST00000560208 CUX1P39880 1505 aa41.54■■■■■ 4.24
CRNDE-209ENST00000560208 SOGA1O94964 1423 aa41.54■■■■■ 4.24
CRNDE-209ENST00000560208 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
CRNDE-209ENST00000560208 TRIM41Q8WV44 630 aa41.49■■■■■ 4.23
CRNDE-209ENST00000560208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CRNDE-209ENST00000560208 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
CRNDE-209ENST00000560208 WDR97A6NE52 1622 aa41.3■■■■■ 4.2
CRNDE-209ENST00000560208 FBLN2P98095 1184 aa41.25■■■■■ 4.19
CRNDE-209ENST00000560208 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.19■■■■■ 4.18
CRNDE-209ENST00000560208 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.19■■■■■ 4.18
CRNDE-209ENST00000560208 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.19■■■■■ 4.18
CRNDE-209ENST00000560208 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.15■■■■■ 4.18
CRNDE-209ENST00000560208 GRIN2BQ13224 1484 aa41.12■■■■■ 4.17
CRNDE-209ENST00000560208 ARHGEF11O15085 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
CRNDE-209ENST00000560208 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.07■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.04■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.01■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
CRNDE-209ENST00000560208 PBRM1Q86U86 1689 aa41.01■■■■■ 4.15
CRNDE-209ENST00000560208 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
CRNDE-209ENST00000560208 SYNJ1O43426 1573 aa40.97■■■■■ 4.15
CRNDE-209ENST00000560208 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.96■■■■■ 4.15
CRNDE-209ENST00000560208 SYNJ2O15056 1496 aa40.92■■■■■ 4.14
CRNDE-209ENST00000560208 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
CRNDE-209ENST00000560208 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.8■■■■■ 4.12
CRNDE-209ENST00000560208 ARAP1Q96P48 1450 aa40.71■■■■■ 4.11
CRNDE-209ENST00000560208 ADAMTS12P58397 1594 aa40.61■■■■■ 4.09
CRNDE-209ENST00000560208 GRIN2AQ12879 1464 aa40.59■■■■■ 4.09
CRNDE-209ENST00000560208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.57■■■■■ 4.08
CRNDE-209ENST00000560208 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
CRNDE-209ENST00000560208 NUP160Q12769 1436 aa40.43■■■■■ 4.06
CRNDE-209ENST00000560208 CEP170Q5SW79 1584 aa40.42■■■■■ 4.06
CRNDE-209ENST00000560208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
CRNDE-209ENST00000560208 KIF27Q86VH2 1401 aa40.23■■■■■ 4.03
CRNDE-209ENST00000560208 SHROOM2Q13796 1616 aa40.21■■■■■ 4.03
CRNDE-209ENST00000560208 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CRNDE-209ENST00000560208 IGF1RP08069 1367 aa40.16■■■■■ 4.02
CRNDE-209ENST00000560208 CUL7Q14999 1698 aa40.07■■■■■ 4
CRNDE-209ENST00000560208 JPH4Q96JJ6 628 aa40.06■■■■■ 4
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